genbank序列格式的特征是什么（genbank）

大家好，我是小房，我来为大家解答以上问题。genbank序列格式的特征是什么，genbank很多人还不知道，现在让我们一起来看看吧！

1、GenBank序列数据库GenBank是美国国立卫生研究院(NIH)维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。

2、每个纪录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。

3、目前GenBank中所有的纪录均来自于最初作者向DNA数据库的直接提交。

4、蛋白质数据库：60年代初，Dayhoff和他的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列，这就是《蛋白质序列与结构图册》。

5、这一蛋白质数据库后来成为蛋白质信息资源PIR。

6、核苷酸数据库：1982年在欧洲分子生物学实验室(EMBL)诞生，随即就开始了一个数据库爆炸的时代。

7、后来NIH搞了GenBank。

8、日本的DNA数据库(DDBJ)加入了数据收集的合作。

9、国际DNA序列数据库合作计划。

10、规定了数据记录和更新的规则。

11、国际核苷酸序列数据库合作成员GenBank--DDBJ--EMBL。

12、GenBank指的是DDBJ/EMBL/GenBank开发利用这些信息的工具（如NCBI的信息检索系统nbsp;Entreznbsp;http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/）编码序列(CDS)：大多数蛋白质序列都不是直接由实验确定的，而是通过DNA序列得到的。

13、这种方法需要进行大量的实验、计算以及相似性比对工作。

14、他也赋予一个产物名称，或者功能说明(通过主观的对相似性比对的分析)。

15、数据库的格式与内容：数据库被用来存放原始数据和一系列附加的信息。

16、不同的检索工具和程序利用了这些信息中的不同部分。

17、FASTAnbsp;格式：广泛应用于许多分子生物学软件包之中。

18、作为最简单的情况，大于号(amp;gt;)表示一个新文件的开始。

19、通常60个字符一行。

20、amp;gt;gb|AF150991|AF150991nbsp;Trichoplusianbsp;ninbsp;singlenbsp;capsidnbsp;nuclearnbsp;polyhedrosisnbsp;virus.ensuresnbsp;greaternbsp;occlusionnbsp;bodynbsp;stabilityproduct--p10nbsp;/nbsp;p10nbsp;proteinaatcgtttaacatatcgcgatctacctagaaatattgccatttttcacaataaaaaagagagaaagccatctctttggtggaaggcgaatacgaaatacacagatttagattggacggctccgttgattgtccctcaataaaattacatataataagtataaatccatttatcgtataaatattaaaaaaaattaaaacatgamp;gt;gb|AF275264|AF275264nbsp;Helicoverpanbsp;zeanbsp;nuclearnbsp;polyhedrosisnbsp;virus.complementproduct--e66-likenbsp;proteinnbsp;(partialnbsp;DNAnbsp;sequence)ctaatgtacgtatggaatgctggcaactatcaacgtctcagcaaaaatctcgaacccagtgtgatcaactactacggcgatgttaaaccttggcaaatcgtggacgataataaaatattgtacatggatctgttcatttggaagtattttagaatgctaatggaaagagacatgaaataagtattatacgcgaatacattatgamp;gt;gb|AF275264|AF275264nbsp;Helicoverpanbsp;zeanbsp;nuclearnbsp;polyhedrosisnbsp;virus.complementproduct--p13tggatcttttcgttcgaaacgagccgtaatattttgctaataattaattcatgccacacccaaattatattatatgagataacattgtaacttcatgacatcatttgtttgaaaaggtccgggcaacatttgataaattacaaaaaagtgcgggcaaagtttgattggtattcgcgtacaattgttaaggagatatcggaatgamp;gt;gb|AF275264|AF275264nbsp;Helicoverpanbsp;zeanbsp;nuclearnbsp;polyhedrosisnbsp;virus.product--Orf50-likenbsp;proteinattaaaaatatgat。

本文到此讲解完毕了，希望对大家有帮助。

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